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《生物信息学导论》课程 （2007年春季学期全校本科生通选课） Introduction to Bioinformatics，00331680，Spring 2007

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课程信息 课 程 号： 00331680 学 分： 2 周学时：2 开课单位：北京大学工学院生物医学工程系、北京大学理论生物学中心 授课对象：全校本科生 开课教师： 朱怀球 （进入研究小组主页） 上课时间、地点：文史楼101教室，每周二下午9－10节（16:50－18:40） 联系方式：(010)62767261(Office)，(010)62759647(Lab)， hqzhu@pku.edu.cn

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课程设置目的及主要内容

生物信息学（Bioinformatics）是现代生命科学与计算机科学、数理科学、化学等领域相互交叉而形成的一门新兴学科。它通过对分子生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析，进而达到揭示这些数据所蕴含的生物学意义的目的。随着人类基因组计划（HGP）的不断推进，生物信息学已经成为当今生命科学和自然科学的核心领域和最具活力的前沿领域之一。

当前，作为介绍生物信息学领域基本背景知识的课程已经开始引入国内许多高校的本科生教育，甚至有高校开设了生物信息学/生物信息技术的本科生专业。基于上述考虑，任课教师在多年教学的基础上，并结合自己在生物信息学领域的研究认识，开设一门以介绍生物信息学领域基础知识和概貌的、适合全校理工科院系本科生通识教育的课程《生物信息学导论》。

本课程首先结合人类基因组计划介绍生物信息学的历史发展和概况，然后顺序介绍生物信息学的主要研究内容，包括生物信息数据库和生物信息学主要问题、生物序列的相似性比较及其数据库搜索、基因预测、基因组进化和分子进化、蛋白质结构预测，同时还专门介绍生物信息学常用的研究方法--多元统计分析方法、随机过程模型、机器学习方法等基本知识。 本课程注重学科交叉、融合，以介绍概念、思想和方法为主，启发学生综合运用数学、物理、工程科学和计算机知识的能力，拓宽知识面，了解学科前沿和最新进展，培养跨越生命科学、计算科学、数理科学等不同领域的"大科学"素质和意识，为今后选择新兴交叉学科领域进行深造奠定基础。

主要参考书目

1． Westhead et al., Bioinformatics（英文原版），科学出版社，2003年
2． Pevzner，Computational Molecular Biology，MIT Press，2000
3． Durbin等, Biological sequence analysis（英文原版）, 清华大学出版社，2002
4． Brown著，袁建刚等译，基因组，科学出版社，2002年
5． 郝柏林、张淑誉，生物信息学手册（第二版），上海科学技术出版社，2002年
6． Mount，Bioinformatics-Sequence and Genome Analysis，科学出版社，2002年（中文版由钟杨等译、高等教育出版社2003年出版）
7. Pevsner J.著，孙之荣等译，生物信息学与功能基因组学，化学工业出版社，2006年

课程讲义下载
(PPT文件，都压缩成RAR格式文件，将随教学进度提供下载)

参考文献选读 (2005)

课程研究作业 (2006)

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